Một trong những yếu tố lớn nhất ảnh hưởng đến sự lựa chọn của doanh nghiệp về việc triển khai CRM là chi phí. Nhưng thực tế việc xác định chi phí của một phần mềm CRM có thể là cả một vấn đề với nhiều doanh nghiệp.
Có rất nhiều chi phí ẩn và các chi phí phát sinh mà các tổ chức có thể dễ dàng bỏ qua khi chỉ ra họ sẽ phải trả bao nhiêu tiền mỗi tháng khi triển khai phần mềm CRM.